Illumina Bio-Rad单细胞测序解决方案

“2016年1月11日，来自加州Hercules和圣地亚哥的消息——Bio-Rad Laboratories公司和Illumina公司今天宣布了一项独家合作伙伴关系，以开发单细胞分析的最全面新一代测序（NGS）流程。

基于这项合作协议，Bio-Rad公司将开发出基于QX200微滴式数字PCR系统中微滴生成仪的改进版本和相关微滴试剂盒，这种新型仪器将利用公司的核心微滴分区技术来包裹细胞，在细胞裂解及细胞RNA同微滴中的珠子进行杂交后，乳浊液就会破碎，而且在一系列的样品准备步骤后，混合液就会进入到一种由Illumina公司开发的无菌文库准备过程中。测序过程完成后，数据就会流入到Illumina公司的BaseSpace平台中，BaseSpace是一种基于云服务的平台，其可以提供第三方及内部开发的生物信息学应用程序，以便被分析及报告。”

目前该流程已经成功商业化，单细胞RNA测序（RNA-Seq）使研究人员能够通过区分异质群体中的不同细胞个体，更加深入的了解细胞功能、疾病进展和治疗效果。Illumina Bio-Rad单细胞测序方案由测序技术和微滴数字PCR技术各自行业的领导者共同开发，可在单次实验中对数百个至数万个单细胞的转录组进行分析，为研究人员提供了强大的、可拓展的、用户友好的工作流程。

l  从单细胞捕获到文库制备的流程可在2日内完成，并包括不少于4个安全停止点。

l  每张芯片（Cartridge）可在5分钟内获得不少于1000个单独包裹于微滴中的有效单细胞。

l  Beads悬液中包含了带特异性寡核苷酸序列条形码（Barcode）的Beads，以及特异的分子标识符（Unique Molecular Identifier, UMI）。

l  在微滴内完成细胞裂解与cDNA第一链的合成，破裂微滴后完成cDNA第二链的合成以及文库构建。

l  使用基于转座酶（Transposome）的技术进行文库构建，该建库过程针对单细胞RNA-seq进行了特殊优化，提高了单细胞RNA-seq的灵敏度。

l  微滴包被细胞的过程，无细胞粒径的偏好性，可以很好的兼容不同粒径大小的细胞。最大可包被50μm的细胞。

l  试剂盒包含从细胞悬液buffer、微滴生成的所有试剂、反转录试剂、文库构建的所有试剂，集实验流程的所有试剂于一体，整合型的试剂方案有助于提高实验的稳定性和重复性。

l  检测灵敏度：可检测5000-7000基因/细胞。

l  简洁而强大的BaseSpace单细胞数据分析App，支持测序数据的一级与二级分析。可一键快速设置分析选项、简便的数据QC结果、单细胞特定转录本的数据匹配、多种数据结果类型的展示，如PCA、tSNE以及热图分析等。